产生生殖细胞和繁衍后代的器官系统。可分为雄性和雌性两类。低等动物中不少是雌雄同体，一个个体内同时具有这两类生殖系统；大多数高等动物则为雌雄异体，分别具有雄性或雌性生殖系统。雄性生殖系统主要有精巢（又称睾丸）、输精管、副性腺和阴茎。雌性生殖系统主要包括卵巢、输卵管、子宫和阴道（图1）。精巢和卵巢属于生殖腺，能产生生殖细胞（精子或卵子）和分泌生殖激素（雄激素或雌性激素），后者有刺激或调节生殖系统和副性征的发育。输精管和输卵管不仅具有输送生殖细胞的功能，其附属腺体的分泌物还有促进生殖细胞进一步成熟的功能；在体内受精的动物，输卵管还是卵子受精及早期胚胎发育的场所。哺乳动物的子宫为胚胎发育提供合适的条件；阴茎与阴道分别是雄性和雌性的交配器官，后者还作为胎儿娩出时的产道。脊椎动物生殖系统的末端开口于泄殖腔或其衍生结构。图1 雄性和雌性生殖系统（大白鼠）

图1 雄性和雌性生殖系统（大白鼠）

原生动物尚未分化出专一生殖类器官，其有性生殖借不同配子的融合（交合）或原核交换（接合）（见世代交替）来实现。双胚层腔肠动物（水螅）开始出现雌雄同体或雌雄异体的性个体，但只在冬季由外胚层形成临时性的生殖腺，生殖细胞成熟后直接排入水内，因而既没有输送生殖细胞的管道，也没有交配器官。三胚层的无脊椎动物有雌雄同体和雌雄异体，并由于中胚层的形成，促进了体内各器官系统的发展；其生殖系统已具有固定的生殖腺（精巢、卵巢）、生殖管道（输精管、输卵管）和附属腺（前列腺、卵黄腺等）；体内受精的动物还有交配器官（交合刺、阴茎等）。不过，棘皮动物由于附着生活的影响，体形变为辐射对称，其生殖系统次生性地退化，如海星只保留生殖腺而无生殖管道，生殖细胞不经体腔而直接由生殖孔排出体外。

脊索动物中的文昌鱼为雌雄异体，生殖系统很简单，仅有20余对生殖腺而无生殖管道，成熟的生殖细胞从生殖腺破裂而出。

最低等的脊椎动物（圆口类），其生殖系统仍保持着许多原始特征，也只有生殖腺而缺乏生殖管道；生殖腺在幼体时（如盲鳗）为两性腺，到成体才分化为睾丸或卵巢，因而在个体发育中先为雌雄同体，而后变为雌雄异体。鱼类以上的脊椎动物均为雌雄异体，一般具有生殖腺、生殖管、副性腺和交配器等完整的生殖系统（图2、3）。

图2 鲨鱼的生殖系统

图3 鸡的生殖系统

来源于胚胎期的生殖嵴，经历原始性腺阶段（性别未分化期）而后发育为睾丸或卵巢（见睾丸、卵巢）。

睾丸，成对位于雄体两侧，鲨鱼的两睾丸后部可融合。多数位于体腔。不少哺乳动物（灵长类、大多数食肉类和有蹄类等）的睾丸出生时则下降到体外阴囊内，因体内温度较高不利于精子发生；鸟类的睾丸虽位于体腔内，但因贴近腹气囊处的温度较低，不影响其精子发生。睾丸通常较光滑而致密，大小随生殖季节稍有变化，许多鸟类和哺乳类的左侧睾丸略大于右侧。睾丸呈长形（大多数鱼类、蚓螈、有尾目）或卵圆形（某些软骨鱼类、无尾目、羊膜类），由无数精细管构成，精子在其中发生（见睾丸）。

卵巢，形态多样，有长有短，有的光滑或凹凸不平，还有的坚硬或柔软。多数成对，位于体腔中线两侧，有些（如许多硬骨鱼）由于卵巢体积太大，在成体或多或少相融合；还有些一侧发达，另一侧退化，如软骨鱼（星鲨）的右侧发达，左侧退化。鸟类（隼形目除外）的则相反。卵巢大小常随繁殖周期而变，如鱼类、两栖类和鸟类繁殖期的卵巢急剧生长，几乎占满整个体腔。其结构一般为实心状，基质较多，但两栖类的基质退化而使卵巢呈囊状，囊腔实际是淋巴腔，因而柔软而有皱襞。成熟卵挂在腔内，排卵时囊壁破裂而入体腔。鸟类和哺乳类的卵巢内有无数球形的卵泡，内含卵母细胞，卵母细胞随着卵泡发育而生长，达到成熟初期即排卵；哺乳动物排卵后的卵泡转变为黄体（见卵巢）。

雄性和雌性生殖管分别起源于胚胎期的原肾管（即沃尔夫氏管）和旁中肾管（即缪勒氏管）。后者由前者纵裂而来（板鳃类和有尾类），或由体腔上皮内卷而形成（多数陆生动物）。在性别未分化期，胚体内同时存在着这两套导管，随着性别的分化向不同方向演变。在雄性，沃尔夫氏管演变为输精管，其头端高度盘曲形成副睾内导管，缪勒氏管退化。但在肺鱼类和少数两栖类的雄性成体中仍保留着缪勒氏管。雌性则相反，缪勒氏管演变为输卵管、子宫和阴道，沃尔夫氏管则退化。

雄性管为封闭的管道系统。精子从睾丸产生后直接通过输精小管（附睾内）进入输精管而不入体腔。板鳃类和许多两栖类，其输精管同时具有输精和输尿的作用，在羊膜动物则专作输精之用。真骨鱼类缺乏真正的输精管，精子通过包围睾丸外面的腹膜延续形成的腹膜管（作“输精管”）从泄殖孔排出体外。输精管管壁具有纤毛上皮，肌层较厚；有些动物其末端有膨大部，内含分支管泡状腺，称壶腹腺。

雌性管在脊椎动物中一般变化不大，通常成对，并与泌尿管分开。只在鸟类仅左侧的发达而右侧退化。真骨鱼类缺乏真正的输卵管，所谓的“输卵管”与输精管一样，也是由包围卵巢外面的腹膜直接延续形成的。这样，大量卵子释放时不致落入体腔而伤害自身。有些脊椎动物的输卵管一端开口于体腔，其卵子先排入体腔，而后进入输卵管。软骨鱼类（鲨鱼）输卵管的体腔口左右靠拢合并为一（图2）。在肺鱼类和两栖类，输卵管的结构最简单，管壁大部分具有纤毛和腺体，后段很少特化，除少数胎生的蝾螈和蟾蜍外，通常只有一个简单扩大的卵囊，以贮存卵子。在软骨鱼类、爬行类和鸟类，输卵管分化为几个特化部分，这与产生大型的有壳卵有关，如软骨鱼类的输卵管中部有特殊的壳腺，能分泌卵白和卵壳物质；后部扩大成子宫，以暂时贮存卵子或作为胚胎发育的场所（星鲨和犁头鳐科）；在爬行类和鸟类，其前段壶腹部含有丰富的腺体，能分泌大量卵白，又称卵白分泌部。后部扩大为子宫，也富有腺体，且多肌肉，其分泌物形成卵壳。胎生哺乳动物，由于产卵量少，卵子体积小而无卵壳，其输卵管前段简单，后段特化为具有丰富肌肉和腺体的子宫，供胚胎在其中发育。有胎盘哺乳类的左右子宫有几种不同的愈合情况，形成四种类型。如袋鼠、兔和啮齿类的为原始类型不愈合，称双子宫；猪、马的子宫，左右末端愈合；如牛、羊、食肉类和鲸类的子宫称双分子宫；子宫体部完全愈合而子宫角不愈合，称双角子宫：高等灵长类的子宫全部愈合为一，称单子宫。鸟类和哺乳类的子宫末端连阴道；有袋类的很特殊，有两个管状的侧阴道，近端（头端）愈合为阴道窦，远端（末端）也愈合为一，通入泄殖窦；在高等有胎盘类完全愈合为一，通入阴道前庭。

许多哺乳类雄体中有精囊腺，前列腺和尿道球腺三大副性腺，它们均位于输送精子的通道上。系复管状腺或复管泡状腺，精囊腺起源于输精管上皮；前列腺和尿道球腺则起源于尿道上皮。它们的分泌物与副睾、输精管壶腹部的分泌物以及精子共同组成精液。小鼠、大鼠、金黄仓鼠精囊腺的内侧还有呈分支管状的凝结腺，其分泌物参与阴道栓的形成。

体外受精的动物缺乏交配器，如大多数真骨鱼类和两栖类。少数胎生真骨鱼具有鳍脚状的交接器，由肛鳍演变而来，称生殖脚，有沟或管能将精子导入雌体内；有些杜父鱼（Cottus）具有伸长的生殖乳头以代替生殖脚，有阴茎的功能。软骨鱼类、爬行类和哺乳类为体内受精，均有特殊的交配器官，如雄鲨由腹鳍演变出一对棒状突出物，称鳍脚，内侧有沟可将精子输入雌体内；蛇和蜥蜴的雄体有半阴茎，平时隐藏在泄殖腔内，交配时因充血膨胀而伸出体外，完成插入雌体泄殖腔内。鸟类行体内受精，但大多数的交配器官次生性地退化，只有鸵鸟和雁鸭类有突起状的小阴茎，位于泄殖腔的腹侧壁上，主要由深层的纤维体和表层的海绵体构成，平时也隐藏在泄殖腔内，交配时则勃起翻出体外；公鸡仅有残存的阴茎乳头，呈小球状，平时不明显。低等哺乳类（单孔类）的阴茎与爬行类的相似。真兽哺乳类的阴茎最发达，始终伸出体外，主要由一对阴茎海绵体和包围尿道的尿道海绵体构成。海绵体内有许多血窦，当充血时，使阴茎勃起，故海绵体又称勃起组织。整个阴茎内有尿道的延伸部（尿殖管）通过，是精液和尿液的共同通道；阴茎头（龟头）周围包有皮肤皱襞，名包皮。

泄殖腔是脊椎动物的一种原始结构，位于躯干末端的腹侧面，是一个与体外相通的囊状凹陷，其中有消化、泌尿和生殖管道的开口。板鳃类和肺鱼类有典型的泄殖腔，辐鳍鱼类的泄殖腔消失，低等辐鳍鱼和部分真骨鱼以肛门和泄殖窦孔开口于体外，其他真骨鱼则以肛门、生殖孔和排泄孔分别开口。两栖类、爬行类和鸟类均有泄殖腔。鸟类的泄殖腔被分隔为粪道、泄殖道和肛道三部分，粪道和直肠相通，泄殖道内有排泄和生殖道的开口，肛道的外口称肛门或泄殖孔（图2）。哺乳类最低等的单孔类尚有与鸟类相似的泄殖腔，绝大多数高等有胎盘类的泄殖腔则已完全消失，肛门与泄殖道分别开口于体外。