保证畜禽健康，防止疫病发生和流行采取的措施和设施。是畜牧生产的基本保证。畜牧场规模越大，生产集约化程度越高，发生疫病的风险越大，一旦发生造成的经济损失也越大。

传统的防疫只限于对传染性疾病和寄生虫病的防治，通常借用日常的消毒，定期注射疫苗和驱虫来控制。随着畜牧生产的日益集约化和兽医卫生科学的发展，防疫的含义已引申到遗传性疾病，营养性疾病，代谢性疾病以及环境性疾病等带有群发性或爆发特点的疾病的防治。这些疾病彼此之间往往互相影响，相互制约。

传统的传染病的传播和流行是在病原体、传播媒介（途径）和易感动物三者同时存在的情况下发生的。因而传统的疫病防治办法，不外乎杀灭病原体、阻断传播途径和提高动物的免疫力和抵抗力。但是集约化生产条件下出现的所谓“现代疫病”则多是非病原性的。因而，传统的靠给畜禽注射疫苗，形成免疫力的作法，已很难奏效。此外越来越多的临床试验证明，即使是传统的传染性疾病，当畜禽在不良生产条件下，其活动和行为习性受到压抑或营养失调时，注射疫苗后往往使免疫能力降低或不能形成免疫力。因而，在现代化畜牧生产条件下，畜牧场防疫工作除传统的综合防疫体系外，还应当包括遗传学的、营养学的、环境学的和管理学的措施。

建立严格的防疫体系与制度是畜牧生产的有效保证。防疫体系包括：①选择安全地段，并按合理的场区布局原则与要求建场。②畜牧场，特别是生产区应严格封闭，与其他功能区、居民点要保持适宜的防疫安全间隔，设置严密的界墙、隔离沟和隔离林带。③在畜牧场生产区与畜舍的入口处必须设置消毒池，进入的人、畜、车、设备、用品要严格消毒。④场内、场外运输要严格分开。场内外运输工具不得越范围作业。⑤尽可能实行封闭式生产，如需从场外购进畜禽须按兽医法规进行严格检疫、隔离饲养，证明确实安全时方可进场。⑥购进饲料、原料或使用商品饲料均不允许从场外直接运进生产区内。⑦应按畜种、当地疫病流行状况制定免疫程序和预防治疗程序。⑧定期进行畜舍、设备、畜体的严格彻底的消毒。实现“全出全进”制，为进行彻底消毒提供了保证。⑨对畜牧场废弃物进行有效的管理、处理和利用。⑩严格按兽医法规焚烧因各种原因致死的畜禽。⑾严格保护水源，防止被污染。⑿为家畜提供必需营养的、完善的日粮。⒀保持畜舍内适宜的环境状况。空气污浊、潮湿、过分拥挤、畜禽失去必要的活动、设备用具的设计与安装违背畜禽生物学特征、行为习性，往往是导致畜禽环境应激、代谢紊乱、行为异常的原因。⒁制订严格的个人卫生制度。进入生产区应严格消毒、沐浴、更衣；禁止将杂物，特别是肉类及其制品带入生产区内；人员外出办事返场，需在场区净化2～6天后，经沐浴、更衣方准进入生产区；本场从业人员家中禁止饲养同类家畜；定期检查身体，一旦发现感染人畜共患病，应调离生产区。⒂非本场人员不得进入生产区。