乌拉尔甘草种子呈圆形或肾形，略扁，长2.5～4.5毫米，宽2.5～4.0毫米，厚1.5～2.7毫米，表面光滑，暗绿至棕绿色，或黄棕色至棕绿色，以棕绿色者居多；种脐在一侧，中心下陷呈暗棕色小圆点，合点在种脐的下方，呈较种皮色深的斑点，两者相连为种脊，为一暗棕色条纹，质地坚硬，齿啮不破。

种皮外层革质，厚0.20～0.25毫米，内胚乳紧贴于种皮的内侧，周边的较薄；胚发达，子叶肥厚。

种皮外侧为栅状表皮细胞，径向延长，长93～102微米，宽8～12微米，壁特异增厚，表面观呈多角形，细胞腔极小，沿外侧切向面有一条折光性较强、宽7～12微米的明线，细胞腔靠外侧的2/3部分极狭窄，内侧的1/3部分呈三角形，内含暗棕色树脂类物，表皮细胞内侧是一层柱状下皮细胞，长20～33微米，宽15～26微米，壁增厚柱状，其内为数层膨胀层薄壁细胞，未吸水前，壁皱缩，形状不规则，吸水膨胀成椭圆形至矩圆形，切向延长，内含暗棕色物。膨胀层内侧是内胚乳细胞，层数不定，多达16层细胞，少则2～4层，细胞呈多角形，壁厚，腔小，内含糊粉粒和油滴。两片子叶叠合处为上表皮细胞，其外侧壁稍厚，其内为栅栏组织，细胞3～4层，长32～53微米，宽12～16微米，下表皮细胞与上表皮细胞相似，其内为海绵组织，细胞4～6层；于栅栏和海绵组织间，嵌有细胞极小的原形成层组织；叶肉细胞内均含有大量糊粉粒和油滴。