树木种群内个体间在形态、解剖、生理、生态特性等方面的变异。每一种树由于它长期历史发展以及分化的结果不仅会出现地理差异，也会在同一地区林分内出现个体间在上述性状上的差异。

①冠形与干形：由于枝条的长短、粗细、疏密及分枝角度等的差别，可形成宽冠、窄冠、冠形直立或下垂等不同冠型。例如杉木的冠型，依据其枝叶浓密程度，节间长短和平均轮盘数，可分为浓密、稀疏和一般三种类型。冠型在很大程度上受遗传特性决定的，而外界环境对冠形也有明显的影响，如生长在空旷地的树木冠形宽，生长在密林中的冠形窄，但空旷处也存在有窄冠树木。树木的干型，如通直度等也有明显变异。②树皮：其粗细、结构、厚薄、颜色等变化很大。例如马尾松的树皮有薄皮型和厚皮型两个明显变异。薄皮型树皮薄，鳞状开裂，裂片小而薄，树皮棕黄色；厚皮型树皮厚，呈甲状开裂，裂片大而深，常呈条片状剥落，边缘较整齐，树皮褐色。通常薄皮型的去皮胸径大于厚皮型，单株去皮材积显著增加。③果实与种子：油桐果实有单生和丛生两类。乌桕有葡萄桕和鸡爪桕两大类。繁殖器官的变异多数是比较稳定的。④叶片：阔叶树种的叶片形状、大小、厚薄、色泽等变异较多，且不稳定。即使同一植株，由于叶的着生部位不同或树龄不同也有差异。如毛白杨的叶片形状变化较大，尤其是长在夏、秋梢上的叶片变化更大，春梢上的叶形较一致，一般为阔卵形，叶基心形。针叶的外部特征主要是指针叶的长、宽、厚、色泽等等，其中针叶长度的变异最为明显，因立地条件、营养状况的不同而异，不同年份，甚至因着生部位不同而异，但也存在遗传变异。针叶的解剖特征中以树脂道数量和位置的变异较为明显，松类不同树种的树脂道位置可分为内生、中生、横生和外生等4种，此性状较为稳定。在同一树冠中，以外围和向阳面的针叶中树脂道数量较多；针叶的中部较针叶的顶端多；老龄树较幼龄的多。这一性状受遗传性控制。

在对杉木、云杉、杨树等不同个体或无性系的光合作用、呼吸作用、蒸腾作用等测定中，都发现过变异，而这类生理过程的不同常引起生长速度的不同。

树木个体在耐寒性、抗旱性、抗虫性、抗病性等方面是存在着遗传变异的。如不少落叶树种春季放叶的时间参差不齐，有早放叶或晚放叶的，而后者经常可避免晚霜危害。（见抗虫育种、抗病育种）