由于水库蓄水和渗漏使库边与坝下游地带的地下水位上升，引起地面盐碱化、沼泽化、建筑物地基条件恶化及矿坑涌水量增加的现象。浸没问题多发生在河谷宽阔、阶地发育的平原水库，如中国官厅水库蓄水不久，就在大曹家营、西榆林村、新苗家堡等处发生严重浸没，房屋倒塌，墙垣开裂、农作物及果树减产或绝产，浸没地带宽达几公里，长十几公里；坝基防渗处理如不够妥善，坝下游也会浸没。河北黄壁庄水库曾发生过，补充处理后才消失；渠道、运河、地上河堤防的渗漏也会造成浸没；峡谷水库沿岩溶或断裂带渗漏时，在邻谷低地或洼地出现浸没，如云南水槽子水库蓄水76天后，即在水库西南2～3公里，低于库水位145米的那姑盆地白雾三村一带发现地下水涌出地表，不久又漏向13公里外的蒙姑，农田房屋都发生浸没问题。

水库浸没是库岸地貌、地质、气象、水库运用等多种因素作用的结果。研究步骤一般是：①在水库工程地质测绘基础上，针对可能浸没地段，选择代表性剖面进行勘探和试验，了解岩土结构，各层的土质、厚度、含盐量、渗透系数、毛细水上升高度、地下水类型、水位、水质、给水度及补给量等。②用计算法、类比法和模型试验计算地下水壅高值。③会同有关单位调查研究，确定地下水临界深度。农田的地下水临界深度与当地气候、土质、地下水的矿化度、作物种类、耕作方法、灌溉和排水措施等有关。工业和农用建筑物区的地下水临界深度与在地基土在浸水后的强度变化、建筑物规模和重要性、基础砌置深度、防设等情况有关。④预测浸没范围和浸没程度，由于计算地下水壅高值公式的局限性和地质条件的复杂性，计算成果与实际情况往往有出入，因此在确定浸没范围时常增加一些安全值。⑤提出防治措施。

根据各地经验，下列地段可能发生浸没问题，要进行专门研究：①平原型水库的坝下游、顺河坝或围堤外（背水）侧的低洼地，特别是地面高程低于河床的地段；②地下水埋藏浅，地表水或地下水排泄不畅，补给量大于排出量的库岸地段，封闭或半封闭的洼地，或沼泽的边缘地带；③盆地型水库边缘与山前洪积扇相接的地段或其它地貌过渡带。一般情况下，下列地段不存在浸没问题：①库岸为相对不透水岩（土）层组成。或研究地段与库岸间有相对不透水层阻隔；②研究地段与库岸间有常流水的溪沟，其水位等于或高于正常蓄水位时。

水库开始运用时最好选择典型地段进行地下水位和浸没范围的长期观测，并根据当年最高蓄水位、保持时间和已发生的浸没情况，预测第二年浸没发展的可能变化，以便及时采取有效措施，尽量减少损失。

浸没地段的防治措施，一般是布置排渗或疏干工程降低地下水位，而农田还可按当地的水、土、盐等具体条件，采取工程措施与农业措施（如改变作物种类和耕作方法等）相结合的综合防治方案。