世界上报道的粟病害有四五十种，最主要的有黑粉病、白发病、锈病、谷瘟病等，特别是黑粉病分布最广，是印度粟区的主要防治对象。粟胡麻斑病分布甚广，但为害不甚严重。中国古农书已有病害记载，当时主要根据病征取名。如明《本草纲目》有关于“粟奴”、清《马首农言》有关于“怪谷”“竖谷”的记述。20世纪20年代以来，开展了粟病的科学研究，发表了许多论文和专著，对病原的生活史、病害流行与环境的关系、防除方法等均有详细论述。特别是对白发病的卵孢子存活萌发的研究、红叶病病毒通过蚜虫传播的研究、粟瘟病的生理小种分化的研究等，中国科学家作出了主要的贡献。

中国主产区常见病害约10种。感染病害的植株主要表现为两类形式的病征：

第一类侵害茎、叶等绿色组织。发生黑色或褐色的病斑，减少光合作用面积，消耗水分养分，严重时导致叶片枯萎、植株死亡：轻者增加秕粒、降低产量。这类病害主要有：①粟瘟病Piricularia setariae，俗名谷热病、间码、串码等，是一种真菌病害。幼苗期间侵害幼叶形成病斑，重者可致幼苗死亡。带病幼苗的病菌随植株生长而侵害穗颈、穗轴、穗码，致局部坏死。在高温、高湿、多雾年份流行时能使产量降低20～30%，常年在低洼湿地种植发病也比较严重。②粟（叶）锈病Uromyces setariae-italiae，俗名黄疸病、黄锈病，也是一种真菌病害。在长城以北的春谷、华北地区夏谷和南方的粟发病较重。在开花、灌浆期如遇多雨、高温导致夏孢子大量传播时能严重影响产量。③褐条病Pseudomonas setariae，是一种细菌性病害，暴风雨多湿能致病害蔓延。④胡麻叶斑病Helmintho-sporium setariae，是一种真菌病，在叶片上发生黄褐色病斑，仍能正常抽穗。

第二类是穗部病害，病株不能出穗。或穗码受害，花器变形、变色，轻者部分籽粒受害或籽粒秕小，产量降低。这类病害主要有：①白发病Sclerospora graminicola，·俗名灰背、白尖、枪谷、芦心、看谷老等，属真菌病害。病菌的芽管由幼苗芽鞘侵入，可随幼苗生长，在不同生育阶段发病形成不同病征。全国粟田常年普遍发生，有的地块能致严重减产。收获前，病株上的卵孢子已散落土中可以传病；用病株的谷草喂牲畜，在其粪便中残存有活的孢子，可随厩肥传播，故此病较难于彻底防治。②粒黑粉病Ustilago crameri，俗名黑穗、黑疸、黑霉、乌霉，真菌性病害。此病较易防治，但如不采取措施，有时也会局部发生危害。③红叶病Red leaf virus disease，俗名红缨、红毛、红瘟，是通过蚜虫传染的病毒病害，常年都有发生，少数危害严重。④线虫病（不稔病）Aphelenchoi-des besseyi，俗名立穗、瞎穗、倒青。局部地区发生危害，在中国是检疫对象。

此外还有危害幼苗的镰刀菌枯萎病Fusarium sp.。为害根部的根腐病Achlya flagellata因受害部分在地下，且幼苗数量多，轻时尚不易察觉，严重时能导致缺苗。

病害的种类众多，常年造成的产量损失不下10～20%，特别在雨量较多的年份，次生感染而流行能致部分失收。有的病害在施氮肥过多条件下发生严重，最后造成严重减产。

主要应采用预防为主、综合防治的方针。针对本地常年发生的主要病害，采取清除病原的措施。①轮作。粟田禁忌重茬。白发病卵抱子散落土中可以存活三年，次年如种粟即可以为害，最好实行三年以上的轮作。②选用抗病品种。在抗病性鉴定中已发现许多高抗某种病害或兼抗数种病害的品种。适应性良好的多抗性品种可有利于稳产。③种子处理。被黑粉病、线虫病、白发病等病原侵染的种子可以通过种子处理消灭病原。通常可用拌药、清洗、浸种等方法。晒种也可防病，且有提高种子质量的作用。④调节播种期。在地温较低时，种子出土时间延长，增加了土壤中病原入侵的机会。把春粟播种期延迟到5月份，可以减少多种病害。⑤加强田间管理。根腐病类造成幼苗受害时，可以及时中耕、施肥、浇水。某些病害一旦发现带病的组织要及时清除。良好的管理使植株健壮，增强抗病能力。⑥药剂防除。药剂防除对于种子消毒最为有效，如用瑞毒霉素防治白发病，效果可达90%以上。对次生侵染的病害如粟瘟、锈病等，也可用药剂防治。