将收割后的亚麻植株浸在温水麻池中进行微生物发酵，以获取纤维的过程。沤麻的水温应保持30～32℃，pH值为6～7。温水沤麻在脱胶厂进行，能常年作业，不受季节影响，所获纤维品质优良。

温水沤麻麻茎发酵分以下阶段：①物理阶段。麻茎浸渍7～9小时，吸水膨胀，表皮开裂，含氮化合物、无机盐和各种色素溶于水中，麻池水液呈褐色，为好气性细菌积累了丰富的营养物质，同时也为嫌气性细菌进入茎内创造了条件。②生物阶段。此阶段有两个过程，水溶物质发酵过程：当麻茎浸渍7～9小时后，好气性马铃薯杆菌（Bacillus mesentericum）、枯草杆菌（Bacillus subtilis）、八联球菌（Sarcina sp.）等大量繁殖，使水溶液物质发酵，排出大量二氧化碳、氢气和有机酸，液面出现气泡，并形成一层白色薄膜，由于浸液内氧气逐渐减少，产生的气泡缓慢，浸液酸度增高，这段时间麻茎内部组织尚未发生变化。果胶物质发酵过程：当麻茎浸渍24小时后，嫌气性的费地梭状杆菌（Clostridium felsineum）和蚀果胶梭状杆菌（C.pectinovorum）大量繁殖，蚀果胶梭状杆菌在开始的前两昼夜数量多，两昼夜后，这种微生物多数消失。而费地梭状杆菌的数量显著增加，并侵入麻茎组织，分泌酵素分解果胶物质，使麻茎皮层的薄壁组织受到破坏，韧皮部与木质部分离，纤维束被分离出来，达到脱胶目的。

麻茎沤制的适度标准：一是取靠麻茎梢部为全长三分之二处折断，抽出麻骨时，皮骨易分离，不带纤维；二是用手指连续掐断麻茎时能发出清脆的响声。