使获得这一质粒的细菌不再表现抗性；把一个带有氨苄青霉素抗性和四环素抗性基因的质粒pBR322，用限制酶Bam HI处理，由于BamHI的唯一的识别位点是在四环素抗性基因中，所以经同一种酶处理的DNA分子片段就可以连接在这一基因中间；在被转化的细菌中选择只对氨苄青霉素具有抗性而对四环素不具抗性的细菌，便可以获得带有外来DNA片段的载体的细菌；②免疫学方法和分子杂交方法。
用以上任何一种方法连接起来的DNA中，既可能包括需要的DNA片段，也可能包括并不需要的片段，甚至包括互相连接起来的载体分子的聚合体。所以宿主细胞中只有一小部分是真正含有所需要的基因的。一般通过三种方法可以取得所需要的宿主细胞。①遗传学方法。对于带有抗药性基因的质粒，从被转化细菌是否由敏感状态变为抗药的状态，就可以知道它有没有获得这一抗药性质粒；一个抗药性基因中间如果接上了一段外来的DNA片段，就使获得这一质粒的细菌不再表现抗性；把一个带有氨苄青霉素抗性和四环素抗性基因的质粒pBR322，用限制酶Bam HI处理，由于BamHI的唯一的识别位点是在四环素抗性基因中，所以经同一种酶处理的DNA分子片段就可以连接在这一基因中间；在被转化的细菌中选择只对氨苄青霉素具有抗性而对四环素不具抗性的细菌，便可以获得带有外来DNA片段的载体的细菌；②免疫学方法和分子杂交方法。当一个宿主细胞获得了携带有载体上的基因后，细胞中往往就出现这一基因所编码的蛋白质，用免疫学方法可以检出这种细胞。分子杂交的原理和方法同样可以用来检测这一基因的存在（见分子杂交技术和基因文库）。
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