针对果树产区的主要害虫，研究寄主的遗传变异，创造、培育优质抗虫果树新品种的一门科学技术。育成抗虫品种，可以减少使用农药次数，降低生产费用，减轻环境污染和果品残毒；保持害虫与捕食天敌之间的自然平衡，把果园虫害减少到最低限度。

在抗虫育种中，以抗葡萄根瘤蚜（ph-ylloxera vitifolia）和抗苹果绵蚜（Erisoma lanigeru-m）育种成绩最为显著。美国利用沙地葡萄对根瘤蚜的抗性，育成抗根瘤蚜的St.George，已成为根瘤蚜为害严重地区的一种最常用的砧木。英国利用抗绵蚜的苹果君袖品种，育成了MM106抗绵蚜的苹果矮化砧木，已成为北美、澳大利亚、新西兰、南非等绵蚜成灾的地区栽培中最为广泛的砧木。在北美，能耐二点叶螨（Tctyranchus urticae）的两个草莓品种有Comet和Cardinal。20世纪70年代，北美推广了对蚜虫免疫的红树莓品种Skeena和Nootka；能抗根瘤蚜的红树莓品种Canadie和Gleuora。英国推广了对树莓膨管蚜2～4个已知生物型免疫的3个红树莓品种Malling Orion、Malling Delight和Malling Leo。以色列推广了抗根瘤线虫（Meloidogyne javanica）的3个扁桃木品种Alnem 1、Alnem 88和Alnem 201。日本已选出抗栗瘿蜂的板栗新品种丹萍、伊久、筑波等。

包括昆虫、螨类和线虫三个方面。在昆虫中，蚜虫和同翅亚目的其它种，分布最广，为害最烈，被列为抗虫育种的重点。已经开展工作的有：葡萄根瘤蚜、苹果绵蚜、梨绵蚜、玫瑰卷叶蚜（Dysaphis devecta）、悬钩子蚜（Amophorophera idaei）、茶藨子蚜（Aphis grossulariae）、梨木虱（Psylla pyricola）、加州柑橘红介虫（Aonidiella auranti）、越橘叶蝉（Scleroracus vaeeinii）。其次是鞘翅目和鳞翅目的草莓耳喙象（Otiorhynchus ovatus）、葡萄黑尔喙象（Otiorhyn-chus suloccatus）、红树莓红小花甲（Syturus rubi）、苹果和梨苹蠹蛾（Laspeyresia pomonella），桃透羽蛾、脐橙螟等。对中国和日本说来，栗象甲（Curculia probos-cidcone）、栗瘤蜂也很重要。

由于许多螨类已对杀螨剂产生抗药性，一些杀螨剂本身带有剧毒，限制了杀螨剂的使用，特别在采收期间更是如此，因而抗螨育种显得日趋重要。已经研究的螨类有二点叶螨（Tetranychus urticae）、土尔基斯坦叶螨（T.turkestani）和殊砂叶螨（T.cinnabarinus）、榛大蚜螨（Phytoptus avellanae）和苹果全爪螨（Pano-nychus ulmi）。

线虫是大多数果树的一种相当严重的病害，常使树势衰弱，不能连作，影响果树的发展，因而抗线虫育种比抗虫或抗螨育种更为重要。经研究的线虫主要有：桃根斑线虫（Pratlendus pentrans）、柑橘线虫（Ty-lenchus semipenetrae）和葡萄剑叶或扇叶线虫（Xi-phinema index）等。

通过引种、选种等方法虽然也能获得抗虫品种，但收效大，研究多的还是杂交育种。这种方法能将最佳园艺性状与抗虫性状组合在一个品种中，达到预期目标和要求，受到各国育种家的重视。

对昆虫和螨类说来，通常有四种抗性反应类型：①非选择型，寄主植物产生一种障碍物，能抑制昆虫对植株的取食，使昆虫与螨类完全不可能寄生于寄主植物上。②抗生型，在寄主植物的影响下，昆虫的习性发生改变，最终失掉生活能力。③耐性型，指的是寄主植物虽能提供昆虫和螨类的生存，但其受害程度比感虫寄主要轻得多。④避虫型，指的是寄主植物的发育程序，包括展叶、开花或果实成熟期发生某些差异，能避开某些昆虫与螨类的为害。杂交育种中，应选用非选择型和抗生型的品种作抗虫的亲本。日本对抗栗瘿蜂研究表明，其表现简单遗传，凡与抗虫性强的品种杂交后代，多数表现抗虫性强。

寄主的抗虫性能与本身的化学成分和形态特征存在着某些相关，通过这些相关，可以在苗期区别出抗虫能力的差异，提供抗性选择的依据。化学成分与抗性成相关的例子有：细胞激动素含量低能抗桃砧木根瘤线虫。草莓的半烯酒精、法呢醇浓度低能抗硃砂叶螨。镁对全爪螨有直接效应，叶片镁的浓度与抗全爪螨相关。抗梨木虱的梨实生苗韧皮细胞汁的pH值比感虫实生苗通常低。形态特征与抗虫性相关的有：壳闭合质量与抗扁桃脐橙螟呈相关；石细胞增多与梨果实的抗苹果蠹蛾相关。草莓叶面茸毛少的基因型，比茸毛多的基因型覆载二点叶螨数量要少得多。成龄植株芽鳞稀松的品系比芽鳞紧凑的品系螨类为害更严重。

通过饲养害虫并接种到待鉴定果树，经过一定时间观察，从中筛选出抗虫性强的品系，用于生产或育种。主要在温室、养虫室、实验室或田间进行。因昆虫、螨类和线虫种类及寄主种类不同，其饲养方法、接种方法和饲养器皿亦有不同。在经过了一段时间后，被鉴定的群体中即可观察到抗性的分离，从而达到筛选的目的。利用这些筛选方法在田间进行试验，也可获得相似的结果。

1962年奈特（Knight）所进行的苹果绵蚜筛选方法，是将至少长有两片真叶的盆栽实生苗在温室进行筛选，从春季开始一直继续到整个夏季。在温室内易感虫的寄主植物上培养绵蚜蛹，或从已感虫的果园植株收集绵蚜的蛹。每次接种可用骆驼毛刷把至少12个蛹刷在单个的实生苗上。绵蚜群体在一些实生苗上不能成活时，需要在两年期间内，重新接种10次以上如果仍然不能成活，即可分离出抗蚜虫的品系。

在抗性筛选后，对抗性群体，采用常规观察方法进行（见抗病育种），最后选出综合性状良好，兼能抗虫的新品种，经国家（省）品种审定委员会审定后繁殖推广。