具有两种以上不同遗传物质的组织相互镶嵌在植株的同一部分。嵌合体按它们起源可分为自然突变嵌合体，诱变嵌合体和嫁接嵌合体；按它们的组织结构可以分为周缘嵌合体，周缘区分嵌合体，扇形嵌合体和花斑嵌合体；按它们行为可分为物种嵌合体，倍数性嵌合体，基因差异嵌合体和质体差异嵌合体，通常果树上说的嵌合体是指组织结构上嵌合体。

果树梢端一般有3个组织发生层。L^Ⅰ层，又称表皮原层，多为1层细胞，经过垂周分裂，分化为表皮。这层细胞产生突变，可引起与表皮组织有关的性状变异，如茸毛、针刺、表皮细胞中色泽变异等；L_Ⅱ层，又称皮层原层，也多为1层细胞，经过垂周分裂，分化为皮层外层（亚表皮）和孢原组织。这层细胞的突变可引起皮层的变异，孢原组织变异可影响到胚珠和花粉；L_Ⅲ层，又称中柱原层，有多层细胞，经过垂周、平周和斜向分裂，分化为表皮中内层、输导组织和髓心组织。这层细胞的突变可引起相应组织变异，由中柱长出的不定芽和深层组织长出不定芽都可表现变异特征。体细胞突变大多发生于个别层中个别细胞，3层同时发生突变的可能性很小，所以细胞已突变和未突变细胞同时分裂，即形成2种或2种以上遗传结构不同的组织。由于突变细胞所处的位置和发生时期不同，以及层间取代作用的影响，嵌合体组织结构有各种不同的类型（见图）。①周缘嵌合体（periclinal chimera），突变组织占据1～2个组织发生层，又可分为外、中、内、外中、中内、外内周缘嵌合体等6种。②周缘区分嵌合体（mericlinal ch-imera），同一层里有不完全周缘而扩大的区分嵌合体。也可分为外、中、内、外中、中内、外内部分周缘嵌合体等6种。③扇形嵌合体（sectorial chimera），突变组织在3层中都占据一部分。其可分为外、中、内、外中、中内和外中内扇6种类型。④花斑嵌合体（mosaic chimera），突变组织与未突变组织互相穿插，排列不规则。

嵌合体示意图

嵌合体在生长发育过程中可发生转化或使突变组织消失。如周缘区分嵌合体的突变区的腋芽梢可转化为周缘嵌合体，未变区的腋芽梢为非突变体，交界处腋芽梢仍可为周缘区分嵌合体。再如外中内扇形嵌合体，扇面内突变区的腋芽梢转化为同质突变体，扇面外非突变区的腋芽梢为非突变体，交界处的腋芽梢仍为扇形嵌合体。转化和消失还可由组织重排而发生，包括贯穿，即某一层贯穿并占据另一层；颠倒，即两层彼此易位；越界，即同一层内侧方取代。

因为嵌合体不但容易转化，而且突变细胞与正常细胞发生竞争，突变细胞往往竞争不过正常细胞，使突变消失。所以应及时进行分离纯化，具体方法如下：①将突变区的腋芽用嫁接法固定，使不稳定的扇形嵌合体成为稳定的同质突变体，使部分周缘嵌合体成为较稳定的周缘嵌合体；②对中、内层突变的周缘嵌合体，采用连续除芽或辐射法，促使内部突变组织萌发不定芽，成为同质突变体；③对L_Ⅱ突变的周缘嵌合体，采用自交或杂交法选育出优良的同质突变体；④用组织培养法从花斑型嵌合体中分离同质突变体。