研究桃及其近缘属植物的遗传变异，选择培育桃砧木的一门科学技术。桃的忌地性明显、寿命短、根瘤线虫为害十分严重，产量损失可达15%左右。因此一些国家对桃的砧木育种十分重视。

早期桃砧木的选种出现在桃嫁接繁殖兴起以后，虽然有较长的历史，但比桃品种的育种要晚。1936年，美国赫庆施（L.M.Hutchins）从中国云南省引进桃的实生后代，发现它们能抗根瘤线虫，进行了桃砧木的实生选种，这时才开始有桃砧木育种的记载。现在从事桃砧木育种的，只有美国、加拿大、法国和日本等少数几个国家。

对桃砧木育种总的要求是培育亲和性良好，种子发芽率高或扦插生根容易，生长一致，适应性广，抗逆性强的砧木。从发展趋势看，一些国家把育种的重点放在育成半矮化和矮化砧木，和育成抗根瘤线虫砧木方面。桃砧木资源丰富，除桃而外，还有杏、李、扁桃、郁李等近缘属植物。20世纪40年代以来，仅中国就发掘出一批珍贵的桃砧木资源。其中如对根瘤线虫免疫的红花重瓣寿星桃和红根甘肃桃；抗根瘤线虫的云南毛桃、台湾苦桃、可作矮化砧木的毛樱桃（Prunus tomentosa Thunb.）、郁李（P.japo-nica Thunb.）和欧李（P.humilis Bge.）；耐-40℃低温的珲春桃。充分研究和利用这些资源，可以培育出适应不同地区、不同用途的桃砧木。

主要有下列三方面：①引种。日本为了选育桃的矮化砧木，引进了中国不同地区的毛樱桃、郁李进行嫁接比较试验。结果指出：郁李不仅矮化效果好，而且对产量、品质也有良好的影响。毛樱桃虽然矮化，但亲和力差，往往后期死亡。中国的研究也证明：毛樱桃有矮化效果，但在多湿、低洼地区，树势衰弱，容易死树。②实生选种。通过长期的实生选种，已经选出了许多适应不同地区桃砧木。在这些砧木中，有适应欧美国家生产需要的一些栽培品种实生苗；有适应中国暖湿的东南部地区，嫁接亲和性良好，成活率高，生长迅速健壮的毛桃（P.persica（L.）Batsch.）；适应中国北部、东北、西北地区的山桃（P.davidiana Franch.）；适应陕西、甘肃、新疆等省抗寒、耐旱、生长健壮的甘肃桃（P.kansuensis Rhed.）、陕甘山桃（P.potaninii Batal.）、新疆桃（P.ferganensis）（Kost.et Riab.）Kov.et Kost）、光核桃（P.mira Koehne）。20世纪70年代，加拿大哈诺试验站，从波兰引入中国北部的桃实生苗中，选出两个桃的矮化砧木新类型。一是西伯利亚C（Siberian C），早落叶，早结果，接穗品种芽的耐寒性强，比标准砧矮10～15%；另一为哈诺红（Harrow Blood），比标准砧矮20%。③杂交育种。种内杂交方面，吉田雅夫（1967）用日本野生桃赤芽、矮化的寿星桃和抗线虫的台湾苦桃、列玛格桃（Nemgard）为亲本进行杂交，从F₂代中选育出筑波1—10号，具有不同生长势、不同叶色、抗不同线虫的砧木类型。温伯格（J.H.Wein-beger）用列玛格和红叶自然实生苗杂交，从F₃代中选育出列玛红（Nemared），抗线虫，具有易与接穗品种区分的红色叶片。种间杂交有美国雷哥提（R.Rig-goti，1942）在桃和山桃的种间杂种中选出Riggoti N0₂的桃砧木，该砧木可用种子繁殖，实生苗生长相对一致，其杂种优势能对接穗品种发生影响。美国韩森（C.J.Hansen）用扁桃B×桃单系1-8-2的杂种实生群体中，选出了李属无性系Hansen 2168和Han-sen 536，与桃、李、扁桃都表现亲和，对南方根瘤线虫和爪哇根瘤线虫都有免疫性。法国用桃和李杂交，选出两个新砧木类型：迈拉比（Myrabi）抗线虫、耐旱、耐瘠；P2037结果早，耐涝、对线虫免疫。法国伯哈德（R.Bernhad，1949）在桃×扁桃的杂种中获得一些单株，易于繁殖，具有杂种优势，能适应贫瘠土地，抗钙质土引起的缺铁失绿症。从F₂中选出了两个无性系GF 677和GF 557，嫁接树株型矮小，结果早，早期丰产。