研究动物机体患病时的机能、代谢变化及其发生原因和机制，阐明疾病的本质及疾病发生、发展和转归的一般规律的学科。

19世纪中叶，由于临床观察和尸体解剖方法，不能解决对疾病本质的全面认识，于是在疾病病理研究中开始注意生理的或机能的变化。法国学者克劳德·伯纳德（Claud Bernard，1813～1878）首先采用了实验生理学的方法研究疾病时的机能障碍及其发生机制，编写了实验病理学讲义，叙述了病理机能实验的方法，是为病理生理学的始基。俄国学者梅奇尼科夫（И.И.Мечников，1845～1916）关于炎症、吞噬、免疫性、机体自体中毒等方面的论著，在病理生理学的发展史中占有重要地位。俄国学者巴树金（B.B.Пашутин，1845～1907）把普通病理学对疾病的一般讨论以及对器官系统症状的一般记述转向实验方向，研究了饥饿时的代谢变化、坏血病及内分泌腺活动等，提出神经系统在一系列病理过程中具有作用，他于1874年在俄国建立了第一个病理生理教研室和病理生理学派。以后在医学和兽医高等院校建立了病理生理教研室，还建立了世界上仅有的病理生理研究所。1955年在中国的高等兽医教育中开设了家畜病理生理学，在一些科研单位建立了相应的研究室，对畜禽疾病的病因学、发病学、免疫学、遗传学等问题开展了大量研究工作，发挥了应有的作用。

①疾病论，主要阐明什么是疾病及疾病的本质。②病因论，主要阐明疾病发生的原因和条件。③发病论，主要阐明疾病发生、发展和转归的基本机制和普遍规律。④基本病理过程，阐明疾病时可能出现的共同的病理变化，例如物质代谢障碍，水、电解质和酸碱平衡紊乱，水肿，缺氧，炎症，发热，弥散性血管内凝血，休克，应激等。⑤系统病理生理学，阐明各系统在疾病时可能出现的共同的病理生理变化，例如血液系统的贫血，呼吸系统的呼吸衰竭，心血管系统的心力衰竭，消化系统的消化功能障碍，肝胆系统的肝功能不全和黄疸，泌尿系统的肾功能衰竭，神经系统的功能异常等。

家畜病理生理学与家畜病理解剖学密切相关，二者从不同角度研究疾病的本质和疾病发生发展的基本机制和规律。家畜病理生理学为研究患畜机体的机能代谢变化及其机制，要运用基础学科如生物学、遗传学、免疫学、生理学、生物化学、生物物理学等的理论和方法，进行各种实验，其中主要是复制疾病模型的动物实验和临床实验，其结果可为临床实践提供理论依据和重要参考。因此，病理生理学又是一门实践性较强的实验性科学。

20世纪70年代以来，随着自然科学的飞跃发展和各种先进技术的应用，病理生理学也取得了重大进展。对许多医学和兽医学的基础理论和许多疾病的发病机制的认识，例如自由基、应激、炎症介质、淋巴因子、激素、弥散性血管内凝血、免疫功能异常、遗传因素等在疾病发生发展中的作用，休克、肿瘤、心功能不全、肺功能不全、肝功能不全、肾功能不全、多器官衰竭等问题的发生机制，均提高到了一个新的水平，并在临床实践中得到了应用。病理生理学现正利用新的研究手段，在基础病理、疾病病理、临床病理、比较病理等许多领域深入开展研究工作。