微生物的组分及其代谢产物构成的抗原。包括：①外部抗原，如细菌的鞭毛、菌毛、荚膜和病毒的囊膜和衣壳等；②内部抗原，如细菌的芽胞、核蛋白体和病毒的核心抗原等；③分泌抗原，如细菌的外毒素、胞外酶和抗生素等。微生物的每一种结构都有其特定的抗原组成，某些微生物已能据此以符号系统标示（抗原式）
微生物的组分及其代谢产物构成的抗原。包括：①外部抗原，如细菌的鞭毛、菌毛、荚膜和病毒的囊膜和衣壳等；②内部抗原，如细菌的芽胞、核蛋白体和病毒的核心抗原等；③分泌抗原，如细菌的外毒素、胞外酶和抗生素等。微生物的每一种结构都有其特定的抗原组成，某些微生物已能据此以符号系统标示（抗原式），并用于微生物分类及分型鉴定。
由多种结构、若干种抗原成分组成的复合体（图）。
又称O抗原，为细胞壁抗原。由多糖、类脂和蛋白质组成，其抗原特异性在脂多糖部分。菌体细胞壁外膜连接类脂A，类脂A外附着一个由多糖组成的核心称为共同基核（com-man core），在基核上连有多糖侧链，菌体抗原的特异性决定于侧链上单糖的种类、序列及空间构型。革兰氏阴性菌在死亡裂解后，释出细胞壁脂多糖，对机体有微弱的毒性，称为内毒素（endoto-xin）。所引致的抗体能凝集和溶解细菌，但不能中和内毒素。
细菌的结构及其重要抗原的位置
鞭毛抗原（flage-llar antigen）又称H抗原。鞭毛为细菌的空心管状附属器官，由基体、钩状体和丝状体组成，其抗原特异性主要决定于管状体部分。鞭毛由鞭毛亚单位——鞭毛蛋白聚合而成，不耐热，56～80℃即可破坏。鞭毛抗原由相同的决定簇连接排列而成，为非胸腺依赖抗原。盐酸与乙醚可破坏其与特异性抗体的凝集。
又称K抗原，包括荚膜抗原（capsular antigen）和菌毛抗原等。荚膜由细菌分泌的粘液构成，一般为多糖，少数（如炭疽芽胞杆菌）为D-谷氨酸多肽。各种细菌的荚膜多糖互有差异。同种不同型间多糖侧链亦有差异，如肺炎球菌各型的荚膜多糖侧链互不相同，可借以分型。
细菌菌毛（pili.）又称纤毛（fimbriae），其功能为粘附于动物粘膜上皮细胞，故亦称粘附素，存在于革兰氏阴性菌及少数革兰氏阳性菌表面，由蛋白质组成，抗原性强。60℃处理不影响其抗原性。但100℃1小时即可破坏。与相应抗体凝集时对盐酸和乙醚有较强的抵抗力。病原性大肠埃希氏菌的K抗原，如K88、K99、987P、F41等均为菌毛抗原。此外，新分离的沙门氏菌所具有的Vi抗原（virulance antigen）也属于表面抗原。大肠埃希氏菌和沙门氏菌均可根据其抗原结构写成抗原式，如：O8∶K40∶H4。
破伤风梭菌、白喉杆菌和肉毒梭菌等可产生外毒素。外毒素经甲醛或某些方法处理后，毒力减弱，但仍保持免疫原性，称为类毒素（toxoid）。细菌外毒素和类毒素具有很强的抗原性，能刺激机体产生称为抗毒素（antitoxin）的抗体。
外毒素分子的毒性基团与抗原决定簇不是同一物质，但在空间排列上是互相靠近的基团。外毒素可酶解为两个具有不同功能的片段。片段A具有酶活性，为毒素的活性中心；片段B能识别敏感的细胞受体，与之结合，并使片段A进入细胞。抗毒素主要为抗片段B的抗体，对毒素分子有高度亲和力，能在机体内中和毒素，阻止毒素与敏感细胞结合，而抗片段A抗体则缺乏中和毒素的能力。
因病毒的结构与其所处状态不同而异。
具囊膜病毒的抗原特异性主要由囊膜上的纤突所决定，如粘病毒和副粘病毒外膜上的血凝素（hemagglutinin，HA）和神经氨酸酶（neuramini-dase，NA）具有很高的特异性，流感病毒分型即以此为据。HA和NA变异常导致新抗原型出现。
无囊膜病毒的抗原特异性常决定于病毒颗粒表面的衣壳蛋白，如口蹄疫病毒的VP1、VP2和VP3等。这些抗原多具有型和亚型特异性。
真菌抗原免疫原性一般较弱，特异性不强，交叉反应较多，但其分泌的真菌毒素特异性强，是重要的抗原。螺旋体、支原体和立克次体等均具有各自的抗原性，其特异性主要取决于膜抗原和内部抗原。
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