土壤中与有机物结合的含磷物质。主要来源于土壤有机质，植物及土壤的微生物残体和有机肥料。

按化学形态分类，有磷酸肌醇、核酸和磷脂等有机态磷。

磷酸肌醇

与蛋白质等多肽结合的有机态磷化物，包括一系列的化合物，所含磷酸根数目也各不相同，但以含5个和6个磷酸根的化合物最多，含6个磷酸根的又称植酸[C₆H₆（OHPO₃）₆]。磷酸肌醇通常占土壤有机磷总量的10%～50%。磷酸肌醇可和铁铝离子形成极难溶的化合物，这也是土壤中部分有机磷化合物比较稳定的原因之一。

核酸

由若干个核苷酸通过磷酸酯链聚合而成的高分子化合物。分为RNA（核糖核酸）和DNA（脱氧核糖核酸）两类，广泛存在于一切生物体中。核酸在土壤中分解较快。核酸磷只占土壤有机磷的百分之几。但是这部分有机磷盐是构成土壤生物体（biomass）的重要组成部分，因此它的重要性比它实际存在的量可能要大。

磷酯

含磷酸的类脂质。其中重要的是卵磷脂，这部分磷通常占土壤有机磷总量5%以下。但在黑土的B层中，这部分磷可达14%。

含量

各土壤的有机磷含量变幅很大。中国土壤的有机磷含量约占土壤全磷量的20%～50%之间，并大体与土壤有机质含量呈正相关。下表是中国一些水稻土的有机磷含量。

土壤有机磷在微生物作用下进行酶解，最终释放出磷酸。其中一部分被作物（以及微生物）吸收利用，一部分与土壤中的铁、钙结合，形成溶解度较低的磷酸盐。

土壤中有机态磷化物在微生物酶的作用下，逐步降解，最终释放出无机态磷的过程。

土壤有机磷的矿化速率取决于水热条件，一般地说，热带地区高于温带地区。在尼日利亚的研究结果表明，次生林地开垦22个月后，其有机磷含量由起始的194毫克/千克下降到147毫克/千克。在圭亚那的研究结果也表明，磷肥对作物的肥效与土壤有机磷含量呈反相关。但是在温带，在土壤有机质矿化作用处于正常速度情况下，土壤有机质释放出的磷量只占作物需要磷量的一小部分。因此，在矿化速度较慢的温带，在土壤有机磷含量相近的条件下，有机磷为作物提供磷素的作用较热带地区低。

中国某些水稻土的有机磷含量（平均值）

土壤有机磷的矿化速率还受土壤有机质中C/P比值的影响，凡比值小于200，矿化过程中将有无机磷释放；如比值大于300时，不但没有无机磷的释放，反而要从介质中吸收无机磷。因此，进入土壤中的有机残体或有机物质，只有当其含磷量大于2克/千克时，才会有无机磷的释放，否则将会使土壤中已有的无机磷被生物固持。