借助自然界的风压和热压所进行的畜舍内外的空气交换。自然通风经济、节能、简便，但通风效果易受气候因素的影响。

当舍外气流遇到畜舍建筑时，迎风面因气流受阻风压增高而形成正压，在背风面和侧面因产生局部涡流使静压降低而形成负压，如果在正、负压区设窗开口，则气流从正压区的开口进入舍内，从负压区的开口流出，实现风压通风。在畜舍内畜禽不断向外散发体热，有时畜舍还需采暖，而致舍内外空气温度不同。在舍内底部空气受热变轻而上升，并从上部开口溢出，而舍外冷空气则从下部开口流入，实现热压通风。在大多数情况下，畜舍自然通风是在风压和热压共同作用下进行的。

分无管道通风系统和有管道通风系统两种形式。前者指不需专用通风管道，经门窗实行通风换气，适用于温暖地区或温暖季节的畜舍。而在寒冷地区或寒冷季节，为了保温，门窗紧闭，则多设专用通风管道换气。

自然通风一般适用于温暖地区或温暖季节。此外，有效的自然通风要求畜舍跨度不大于12米。

利用侧窗通风，关键在于形成有效对流。窗户的主要功能在于采光，一般在满足均匀采光的情况下，可以满足对通风面积的要求。实测证明：通风面积越大、跨度越小，穿堂风越大；相反，通风面积越小、跨度越大，则穿堂风越小。另据工厂厂房实测，当建筑物跨度小于24米，迎风面和背风面的门、窗及其他洞口总面积均超过各自墙面积的三分之一时，即使室外风速只有0.5米/秒，吹进厂房的风大部分可穿过厂房由背风面的通风口吹出，形成穿堂风。即只要在迎风面和背风面有门窗，就能形成对流通风。夏季门窗全部打开可增强通风效果。开敞式畜舍，通风效果犹好。因畜禽在地面上活动与生活，夏季为形成舒适的气流，以使对流从近地面区，即畜体四周穿过，则以设置地窗为理想。到寒冷时要封闭门窗以保温防寒。这时，进风与排风窗开口均应设在畜舍侧墙上部以使进入舍内之温度较低的新鲜空气先在上方与暖空气混合，避免冷风直接吹向畜体。

在寒冷时门窗封闭后使用。通风管道由安装在屋顶的排气口（管）与侧墙上部檐下约0.4～0.5米的进气口组成。在温暖地区，排气口可采用天窗或通风屋脊（在多雨地区不宜采用）；在寒冷地区多采用竖井式排气管。管道断面为正方形或圆形，有利气流通过。正方形管断面积多采用（50×50）平方厘米～（70×70）平方厘米。排气管均匀垂直安装在屋脊两侧，彼此间距离不小于8米，不大于12米。为使排气管顶端处在负压区，排气管至少应高出屋脊0.6米，而在其上部设风帽，以利用风力造成负压，增强排气能力。进气口则多为直接在墙上开的洞口，其断面常采用矩形，大小一般为（20×20）平方厘米～（25×25）平方厘米，均匀分布在迎风面和背风面侧墙上，两个进气管间的距离为2～4米。

排气风管面积根据所需通风量按下式求得：

畜舍自然通风

式中 A为排气管总断面面积（米²）；L为给定的必需通风量（米³/秒）；V为排气管中的气流速度（米/秒）。

由于建筑物不可能绝对严密，舍门也需开启，故进气口面积，一般以排气管总面积的70%取值。

自然通风效果取决于自然风的状况，故在选址、建筑朝向确定、建筑物布局与畜舍设计时均应充分利用当地夏季盛行风，而躲避冬季冷风。在寒冷地区或夏热冬冷地区应重视畜舍保温设计与防寒管理，门窗应严密，以防冷风渗透；进气管入口应有挡风设施，出口处应设调节装置，以把冷空气导向畜舍上方，避免直接吹向畜体以及便于在大风、寒冷时调节进气口开口面积；排气管应严实不漏气，同时应注意保温，防止潮湿空气在管中结露；注意场区绿化及遮阳，以减弱夏季太阳辐射热影响。