以多个性状为选择目标进行选种的方法。在选种实践中，对种畜优劣的判断通常不能只根据单一性状，而要同时考虑几个性状，如乳牛的产乳量、乳脂率、外貌评分；猪的日增重、背膘厚；鸡的产蛋量、蛋重；绵羊的剪毛量、毛长。同时选择两个或更多性状时，可以采用以下三种方法。顺序选择法一个时期只选择一个性状，待这个性状得到满意的改进后，就停止对这个性状的选择，再选择第二个性状，然后再选第三个性状等等。
以多个性状为选择目标进行选种的方法。在选种实践中，对种畜优劣的判断通常不能只根据单一性状，而要同时考虑几个性状，如乳牛的产乳量、乳脂率、外貌评分；猪的日增重、背膘厚；鸡的产蛋量、蛋重；绵羊的剪毛量、毛长。同时选择两个或更多性状时，可以采用以下三种方法。
一个时期只选择一个性状，待这个性状得到满意的改进后，就停止对这个性状的选择，再选择第二个性状，然后再选第三个性状等等。这种一个一个性状依次改进的方法，又叫逐一选择或单项选择法。这一方法适用于要求短期内达到育种目标的某个主要性状的选择，但不宜长期使用，特别是所选择的性状间有负相关时，则一个性状的提高会导致另一性状的下降。
对每个所要选择的性状，分别制订一个最低的中选标准，只要其中任何一个性状未达标准，就不选留。对多个性状的独立淘汰既可在同时间进行，也可对同一性状在不同时间分别进行，如肉牛群先按6月龄断奶体重选留80%，然后再根据周岁体重选留60%，于是总的中选率为48%。用这一方法选种时，选择性状愈多，中选的个体就愈少。在性状间无相关的情况下，同时选择距平均数一个标准差以上的三个性状，中选的个体就只有16%×16%×16%＝0.41%。而且只要某个性状未达标准，其他性状再好也遭淘汰，不利于对具有某个特别优良性状个体的选留。
又叫综合选择法。将不同性状综合成为一个综合性状。如将乳牛的产乳量与乳脂率折算成4%标准乳量，将猪的日增重与瘦肉率综合成日产瘦肉量，将鸡的产蛋数与蛋重综合成产蛋重等；有的根据不同性状的等级综合评定成总评等级，如产乳量为特等、乳脂率为特等、外貌评分为一等，总评等级为特等。还有的采用总性能指数（TPI），如根据产乳量的预期差值、乳脂率的预期差值以及乳用体型给以不同的加权，综合成一个可比的总性能指数，按总性能指数高低选种。使用最普遍的是选择指数法，即把要选择的多个性状，按其遗传特点和经济效果综合成一个指数，然后按指数高低选留（见选择指数）。
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