属于假单胞菌科。细菌直杆状，大小0.4～0.7×0.7～1.8（微米）。革兰氏阴性反应，以单极生鞭毛运动。绝对好氧，不能还原硝酸也无脱氮作用。最适生长温度25～30℃。菌落一般为黄色，光滑或粘液状，色素是一种溴化芳基多烯酯，称为黄单胞菌色素（Xanthonona-dins）。不能利用天冬酰胺作为唯一的碳源和氧源。0.1%（一般为0.02%）TTC（氯化三苯基四碳唑）抑制生长。DNA中G＋C的mol%含量为63～71。典型种是油菜黄单胞菌。

黄单胞菌属细菌自1883韦克（J.H.Wakker）首次报道风信子黄腐病（Xanthomonas hyacinthi）以后一个世纪内，世界各地许多病植物上分离到大量的类似细菌。最初归入植物单胞菌属（Phytomonas），后因此属名与原生动物的一个属名相重而被取消。道森（W.J.Dowson）于1939年建立了黄单胞菌属。

黄单胞菌属的属、种和种以下的分类从表型特征的数值分析，DNA-DNA同源性，rRNA-DNA杂交技术等方面进行研究。虽然黄单胞菌属和假单胞菌属的一些成员共享rRNA-DNA同源性，而黄单胞菌属特有的黄单胞菌色素和对植物的致病性以及一些生理生化特性与假单胞菌属明显不同（表1）。《伯杰细菌鉴定手册》第7版记述黄单胞菌属有120个种。数值分类和D N A同源性的研究表明黄单胞菌属只有少数种。1974年新西兰戴伊（D.W. D ye）等对大量菌株的表型特征分析发现只有4个种与典型种油菜黄单胞菌的生化试验有明显差异，因此在《伯杰细菌鉴定手册》第8版和《伯杰系统细菌学手册》列出5个种，即油菜黄单胞菌、白纹黄单胞菌、地毯草黄单胞菌、葡萄黄单胞菌、草莓黄单胞菌，其余种列为油菜黄单胞菌的致病变种。1978年根据表型特征，曾将白杨溃疡病的病原细菌（Aplanobacterium popu-li）移入本属作为一个种，即Xanthomonas populi，即将有效发表。近年来，根据rRNA-DNA杂交，DNA-DNA同源性等测定，已确认葡萄黄单胞菌与黄单胞菌无相关性，建议将这个种移出黄单胞菌属，成立一个新属。1990年б利时史温（J.Swings）等根据表形特征，遗传和化学特性的研究，提出油菜黄单胞菌水稻致病变种应提升为黄单胞菌属的一个种，命名为水稻黄单胞菌，包含两个致病变种，即水稻白叶枯病的病原菌X.oryzae pv.oryzoe和水稻细菌条斑病的病原菌X.oryzae pv.oryzicola。黄单胞菌属几个主要种的鉴别试验见表2。

表1 黄单胞菌属与假单胞菌属的鉴别特征

表2 黄单胞菌属几个种的鉴别试验

黄单胞菌属的绝大多数成员为植物病原菌，引起的植物病害遍及全世界，几乎所有高等植物的主要科属植物都发生一种或多种病害。主要症状是叶、茎、果实上的坏死斑（斑点、条斑、溃疡）、萎蔫、腐烂等。十字花科蔬菜黑腐病是世界性病害，水稻白叶枯病和细菌条斑病、禾谷类黑颖病、柑桔溃疡病等都是中国的重要病害。中国报道的油菜黄单胞菌致病变种及其所致病害见表3。

表3 油菜黄单胞菌主要致病变种及其所致病害