由棉炭疽菌引起为害棉花苗期和铃期的一种真菌病害。

世界各主要植棉国家如美国、印度、埃及、中国等，棉花苗期和铃期常见病害。中国长江流域棉区发病重于北方棉区，江苏、浙江、湖北普遍发生，发病率一般在25%～70%。受害棉田严重影响齐苗、健苗、早发。棉铃受害除导致僵铃烂果外，还可诱发其它病原菌复合侵染。

棉籽胚芽破壳时，病菌即侵害根尖，呈水渍状黄褐色溃烂；幼苗出土后，幼茎基部形成褐色梭形病斑，纵裂下陷，四周缢缩；子叶受害，边缘出现黄褐色圆形或半圆形病斑，天气潮湿时，病斑可扩展至全子叶，严重时腐烂脱落；棉苗茎秆上，产生红褐色、长条形、略下陷病斑，天气湿润时病斑继续向纵深发展，扩展到幼茎顶部形成顶腐；铃期发病，初产生暗红色小斑点，后扩大，形成褐色圆形病斑，病部凹陷，中央生桔红色粉状物，病菌侵入铃室后，纤维成灰黑色僵瓣。

病原物为棉炭疽菌（Colletotrichum gos-sypii）。有性态为棉小丛壳（Glomerella gossypii），属子囊菌、球壳目，很少发现子囊壳暗褐色，球形或梨形，100～160×80～120微米，埋生于寄主组织内。子囊孢子8个，单胞、椭圆形，稍弯曲，12～20×5～8微米。无性态属半知菌，黑盘孢目。分生孢子着生在孢子梗上，排列成浅盘状，长椭圆形或短棒形，单胞、无色，9～26×3.5～7微米，孢子梗短，透明，12～28×5微米。分生孢子盘周生刚毛，暗褐色，100～150微米，端尖透明，基部黄褐色，刚毛有分隔，顶端产生分生孢子。该菌寄主范围较广，棉属的4个栽培种，陆地棉（G.hisu-tum）亚洲棉（G.arboreum）海岛棉（G.barbadence），非洲棉（G.herbaceum）均可发生。

分生孢子发芽适温25～30℃，35℃时发芽少，生长慢，10℃时不萌发。病害发生的适宜土温24～28℃，相对湿度85%以上，土壤水分过多，病害加剧。棉苗出土15天内是死苗的高峰期。真叶期病情较轻，病害发生与苗龄关系密切，随着苗龄的增长，气温的上升，茎部木栓组织形成，抗病能力增强。

棉花炭疽病主要由种子传播，土壤内的病残体亦可作为侵染源。病菌分生孢子在棉籽上可存活1～3年。由于棉籽发芽始温与孢子萌发始温均在10℃左右，因此棉籽发芽时病菌很易侵染，以后产生分生孢子扩散传播。棉铃受害，病菌侵入棉籽，种子一般带菌率30%～80%，发病的叶、茎、铃落入土壤，成为土壤带菌的病残体；带菌土壤，既可加重棉苗发病，又可由雨水冲溅侵染棉铃形成“烂铃”。

针对棉种传病和土壤内的病菌存在，防治原则是：种子处理，包括精选良种、晒种、药剂处理，处理棉种的药种有福美双、克菌丹、苯菌灵、甲基托布津等；已推广应用的种子处理剂有多菌灵、代森锰锌以及福美双与丁烯酰胺类农药的复配剂，防治苗期炭疽病的效果都很好。