已报道50多种，其中病毒病害6种，细菌病害3种，线虫病害6种，真菌病害30多种。中国至1958年已发现17种。

为害严重的有燕麦坚黑穗病、燕麦散黑穗病、燕麦冠锈病和燕麦秆锈病。每年造成产量损失约5%～15%。

燕麦坚黑穗病

是世界燕麦产区最重要的病害之一，20世纪20～30年代，在前苏联、美国、加拿大每年均有发生，发病率平均为5%。中国以西北各省，山西北部、内蒙古、四川及贵州等省发生较重。燕麦受害后，病穗呈黑褐色，内含粉末状的冬孢子堆，外包灰色被膜易破裂。病菌孢子互相粘着，不易分散，故称坚黑穗病，病原物为燕麦坚黑粉菌，属担子菌，黑粉菌目。冬孢子球形或卵形，黑褐色，表面光滑无刺，大小为6～9×6～7（微米）。萌发时生担子（图1），有3个隔膜，在顶端及侧方生出4个担孢子。担孢子又以芽殖方式产生次生担孢子。担孢子萌发可形成双核的侵染丝。pH值为4.9时孢子萌发最好。病菌发育最适温度为15～28℃，最低为4～5℃，最高为31～34℃。冬孢子存活期为2年，长的可达5年。种子表面的冬孢子在燕麦种子发芽时，萌发侵入幼苗并扩展至生长点，最后侵害子房破坏麦粒组织，产生大量冬孢子，形成病穗。燕麦坚黑穗病菌有不同的生理小种，不同的小种对不同的品种的致病力存在着明显差异。经10个国际鉴别寄主鉴定，可区分为K₁～K₈等8个生理小种。国际上已命名12个抗燕麦坚黑穗病基因符号，并记述了抗病基因在不同品种的分布及其显、隐性表现。

图1 燕麦坚黑穗病

燕麦散黑穗病

世界上种植燕麦的地区都有发生，是燕麦的重要病害，但为害程度较坚黑穗病轻。中国东北、华北、西北及四川、江苏等地均有发生。除为害燕麦外，还侵染野燕麦（Avena fatua）和鸭茅（Dactylis glomerata）等杂草。主要为害花器，病穗全部或大部小穗的子房受破坏，充满黑色粉末，即病菌的冬孢子。孢子堆外表有被膜，易破裂散出孢子，仅留穗轴。病原物为燕麦散黑粉菌，属担子菌、黑粉菌目。冬孢子圆形或椭圆形，暗褐色，表面有细刺，大小为7～8× 5～6（微米）（图2）。病菌发育温度为5～34℃，适温为15～28℃。冬孢子在燕麦开花期侵入，萌发后入侵护颖和种皮，以潜伏菌丝体休眠，翌春带病种子播种后，侵入幼苗。应用鉴定坚黑穗病菌的鉴别寄主可区分为A₁～A₂₀20个生理小种。已命名的抗燕麦散黑穗病基因共13个，兼抗坚黑穗基因5个。

图2 燕麦散黑穗病

燕麦冠锈病

燕麦栽培区都有发生，就世界范围而言，燕麦冠锈病比燕麦秆锈病为害更重。中国早在20世纪40年代，在西南各地即已发现。除为害燕麦外，还侵害毒麦（Lolium temulentum）等禾本科杂草。并可在鼠李属（Rhammusspp.）植物上转主寄生。燕麦叶、秆和叶鞘上均可受害，病斑为橙黄色椭圆形小点，即病菌的夏孢子堆，以后表皮破裂散出黄色粉末即夏孢子。后期产生黑色略隆起不破裂的斑点，为病菌的冬孢子堆。病原物为禾冠柄锈菌（Pucciniacorona-ta），属担子菌，锈菌目。夏孢子球形或卵形，大小为24～32×18～24（微米）；冬孢子暗褐色，双胞，有柄，大小为36～64×12～26（微米），顶端厚有数个突起，状如王冠，因此称冠锈菌（图3）。夏孢子发芽适温为20℃，10℃以下或25℃以上则不能发芽。冠锈菌有生理分化现象，存在着致病性不同的生理小种。50年代美国的西蒙和墨菲（MarrDixson Simonsand Hick-manCharlesMurphy）筛选的10个标准鉴别寄主共鉴定出472个生理小种。1971年美国的弗来西曼和巴克（George Fleischman and RobertJohn Baker）改用10个近等基因系（near-isogenicline）建立一套新鉴别寄主。国际上确定了69个抗冠锈病单基因系被命名为Pc-1～Pc-69。冬孢子在病部越冬后，翌春发芽产生担孢子侵害鼠李属植物，在叶片正面产生性子器，叶背面产生锈子器。锈子器内产生锈孢子侵染燕麦，而后产生夏孢子再次侵染蔓延。有些地区夏孢子也能越冬，次年发芽直接侵染为害。温暖多雨有利于该病流行。

图3 燕麦冠锈病

燕麦秆锈病

发生普遍，并周期性引起危害，造成损失。美国和加拿大曾多次全国性发生，如1953、1970、1977年均造成损失。中国东北地区及内蒙古自治区，个别年份发生普遍而严重。症状与小麦秆锈病相似。病原物为禾柄锈菌燕麦变种，属担子菌，锈菌目。夏孢子长卵形，表面有小刺，黄褐色，大小为24～40×14～23（微米）。普通小檗（Berberis valgaris）是其转主寄主。性孢子和锈孢子先在小檗上产生，而后再传播到燕麦植株上。燕麦秆锈菌是专性寄生菌。美国的斯塔克曼（Elvin Charles Stakman）等最先研究燕麦秆锈菌生理小种。美国斯特沃特（Donald Mar-tin Stawart）修订后确定7个标准鉴别寄主，共鉴定出97个生理小种。加拿大的马丁（J.W.Martens）和美国的罗尔夫斯（Alan Paul Roelfs）用10个近等基因系建立一套新鉴别寄主，在北美鉴定出54个无毒力/有毒力的组合。国际上已命名的抗燕麦秆锈病基因共17个，编号为Pg-1～Pg-16和Pg-a。

燕麦的其它病害有燕麦红叶病，是一种由大麦黄矮病毒（Barley yellow dwarf virus，BYDV）引起的病毒病害，近年来间歇性地流行，有的年份造成很大损失；燕麦线虫病（Heterodera avenae Woll.）以其为害重，寄生广泛，引起世界主要燕麦区的重视。此外，还有白粉病[Blumeria graminis（DC.）Speer＝Ery-siphe graminis DC.]，赤霉病[Gibberella zeae（Schw.）Petch]，叶斑病[Drechslera avenae（Eidam）Shoemaker＝Helminchosporium avenae Eidam]、炭疽病[Collectotrithum graminicola（Ces.）G.W.Wils.]、霜霉病[Sclerophthora macrospora（Sacc.）Thiium et al.]、麦角病[Claviceps purpurea（Fr.）Tul.]、全蚀病[Gaeumannomyces graminis（Sacc.）Arx et Oliver var.avenae]、叶枯病[Bipolaris victoriae（Meehan et Murphy）Shoem.＝Helmin-thosporium victoriae Mechan et Murphy]、黑茎病（Leptosphaeria avenaria G.F.Weber）、根腐病（Rhizoctonia solani Kühn.）、细菌性叶枯病[Pseudomonas coronafaciens（Elliott）Stevens]和细菌性条斑病[Pseudomonas striafaciens（Elliott）Starr et Burkh.]等。

根据病害的传播和发生特点，可采取单一的或综合性的防治措施：①选用无病种子或进行温汤浸种或应用多菌灵、萎锈灵等药剂拌种；②选用抗病品种；③铲除中间寄主，及时拔除病株；④合理轮作，适期播种；⑤发病后可喷施萎锈灵等杀菌剂。