含硫有机化合物分解所生成的硫化氢及土壤中的元素硫或其他不完全含硫氧化物，在微生物作用下进行氧化，最后生成硫酸的过程。硫主要存在于有机残体的蛋白质内
含硫有机化合物分解所生成的硫化氢及土壤中的元素硫或其他不完全含硫氧化物，在微生物作用下进行氧化，最后生成硫酸的过程。硫主要存在于有机残体的蛋白质内，凡能引起蛋白质分解的氨化微生物都能分解含硫有机化合物产生硫化氢：
硫化作用
参与硫化作用的微生物主要有两大类：
如氧化硫硫杆菌（Thiobacillus thiooxidans）、排硫硫杆菌（Thiobacillus thioparus）、氧化亚铁硫杆菌（Thiobacillus ferroxidans）及脱氮硫杆菌（Thiobacillus denitrificans）等，它们的细胞内无光合色素，属化能自养或化能异养型的细菌。硫化作用在通气良好和无氧的嫌气条件下均可进行。其作用机制大致包括以下4类反应：
2S＋3O2＋2H2O→2H2SO4
H2S＋2O2→H2SO4
5Na2S2O3＋4O2＋H2O→5Na2SO4＋H2SO4＋4S
Na2S4O6＋Na2CO3＋Y2O2→2Na2SO4＋2S＋CO2
主要有紫硫菌及绿硫菌，它们的细胞内有能营光合作用的光合色素，其作用机制是：
硫化作用
这类细菌在氧化硫化氢时，常在细胞内、外形成硫磺颗粒，并进一步氧化为H2SO4，其反应为：3CO2＋2S＋5H2O→3[CH2O]＋2H2SO4故又称硫磺细菌。
硫化作用是有机态及其他形态的硫化物转变为能被高等植物利用的硫酸盐的必经途径。硫化作用产物——硫酸，能提高土壤酸度，甚至使土壤酸化而损坏肥力，降低生产力。然而，因受土壤中硫化作用的强度所限，在通常情况下，土壤肥力不致因硫化作用而受到明显地影响。但对碱性土壤而言，硫化作用则有助于降低pH值，改善其理化性质，可提高生产力，故碱土施用硫磺或含硫物质，常被视为重要改良措施之一。
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