在胃后主要进行消化和吸收的长形管道。末端以肛门与体外相通。可分小肠和大肠。小肠分十二指肠、空肠和回肠三段，胆管和胰管开口于十二指肠；功能为进一步消化来自胃的食糜和吸收营养物质。大肠分盲肠、结肠和直肠三段；功能为消化纤维素，分泌大肠液，吸收水分、盐类和维生素，最后形成粪便。

圆口类的肠为直管状。自真骨鱼类肠显著增长，并出现盘曲。两栖类和爬行类的小肠和大肠区分明显，小肠细而长，多弯曲，大肠较粗、短而直；爬行类始见盲肠（鳄除外），有些龟有一对（见图）。鸟类的十二指肠形成一长襻，空肠盘曲更多，其中部具有一短的盲突，称卵黄囊憩室，是胚胎期卵黄囊柄的遗迹；大肠短而直，称直肠，向后通泄殖腔；盲肠有两条，以短的系膜与回肠相连，鸡、鸭、鹅的盲肠较长，肉食性鸟类和鸽的则很短。哺乳动物肠的长度因动物的食性和胃的类型而异，反刍类为体长的20～25倍；单胃食草动物（奇蹄类）为10倍；家兔为9～12倍；杂食类（猪）为15倍，食肉类为3.7～5倍，人为5～7倍。十二指肠是小肠的第一段，其形态和位置在所有动物大致相同，位于腹前部右背侧，以短的系膜附着于体壁。其起始部在幽门附近形成“乙”状弯曲，胆管和胰管一般开口于此部（牛、兔的胰管开口较靠后），然后转而向后延伸成为十二指肠降部，然后在腰部于肠系膜根后方转向左侧，越过体中线又折转向前，延伸成为十二指肠升部，再延续为空肠。空肠是小肠最长的一段，以长而宽的肠系膜悬吊于腹腔顶壁，并形成许多肠襻。回肠为小肠的末段，与空肠无明显界限，通常以回盲襞作为分界标志。回肠末段一般较直，管壁略厚，色较淡；在人类，回肠的长度超过空肠，二者为3∶2。回肠末端与盲肠或盲结肠交界处相连，并突入其腔内形成回肠乳头（回盲瓣）。兔的回肠末端形成一厚壁的圆小囊，壁内含丰富的淋巴组织。大肠的发达程度各种动物差异很大，多数鲸、熊、大熊猫、河马等无盲肠；狗的盲肠小，呈螺旋状；人类的也很小，并具有一细长的阑尾；马的盲肠形似“逗号”，长约1米，容积约比胃大一倍，表面具有纵肌带和肠袋；兔的盲肠容积很大，表面具有白色的螺旋形线，末端具有似人的阑尾；猪的盲肠呈圆锥状，尖端钝，并具纵肌带和肠袋；反刍类的盲肠宽大，呈圆筒形，无纵肌带和肠袋。结肠是大肠的主要部分，介于盲肠和直肠之间，分升结肠、横结肠和降结肠三段。其形态、大小各类动物差别很大，特别是升结肠。马、猪的结肠很发达，狗的则比十二指肠还细。人和狗的结肠排列成蹄铁状，最后在左髂嵴处移行为乙状结肠。马的升结肠折叠成双层马蹄铁形，最后突然缩细，于肠系膜根前方向左越过中线成为横结肠，延续为较细长的降结肠，又称小结肠，以系膜悬吊，并形成许多肠襻；反刍类的升结肠除始部和终部呈“乙”状外，主要排列成同一平面的圆盘状迷路，先以向心回旋转几圈至中心曲，再以离心回向反方向旋转几圈；猪的升结肠排列成双螺旋形圆锥体，向心回管径大，在圆锥体外周，离心回大部分在内部，管径逐渐变细，各盘曲3～4圈。除狗和反刍类外，猪、马的结肠均具纵肌带和肠袋。直肠位于盆腔内，一般后部膨大形成直肠壶腹，反刍类缺如，末端终于肛门。

图1 几种脊椎动物咽以后的消化道

肠壁的结构也分粘膜、粘膜下层、肌层和浆膜四层。

粘膜形成许多环行皱襞和指状突出的肠绒毛。上皮为单层柱状上皮，细胞游离面具有微绒毛，细胞间夹有杯状细胞及少量内分泌细胞，此外，鸡还常有一种小球白细胞，当幼雏感染球虫病时数量增多，具有局部免疫机制；粘膜固有层内含有许多肠腺，结缔组织中有白细胞、纤维细胞、浆细胞和肥大细胞，血管、淋巴管、神经，以及弥散性淋巴组织、淋巴孤结和淋巴集结等。粘膜肌层由内环、外纵行平滑肌组成。粘膜下层为疏松结缔组织，禽类很薄，局部甚至缺如，哺乳类较发达，内含较大的血管、淋巴管和粘膜下神经丛，十二指肠部还有十二指肠腺或称粘膜下腺，该腺为管泡状腺，分泌物含淀粉酶和二肽酶，以及保护上皮表面免受机械和化学伤害的粘液。腺的分布范围因动物种类而异，有的可伸延至空肠一段距离（猪）或更远（马、牛）。禽无十二指肠腺。肌层由内环、外纵行平滑肌组成，并以结缔组织相连，其中含血管和肌间神经丛。浆膜与胃相似（图2）。

图2 哺乳动物十二指肠纵切面

绒毛由小肠上皮和固有层向肠腔内突出而构成，呈指状、叶状或锥状。固有层中央有一条或两条（绵羊）粗大的毛细淋巴管，称中央乳糜管，末端为盲端，另一端汇入粘膜下淋巴管。中央乳糜管周围有丰富的毛细血管网和来自粘膜肌的平滑肌束。毛细血管的内皮有窗孔，有利于物质的进入，平滑肌收缩时使绒毛缩短，以促进淋巴和血液运行。禽类的绒毛有分支，无中央乳糜管，只有血管网和平滑肌。

肠腺，又名李氏隐窝，是粘膜上皮凹陷形成的单管状腺。多数哺乳动物的肠腺主要有五种细胞组成：柱状细胞、杯状细胞、未分化细胞、潘氏细胞和内分泌细胞。未分化细胞为低柱状，夹于其它细胞之间，可增殖、迁移并分化为柱状或杯状细胞。潘氏细胞位于腺底，锥状，常三五成群，细胞顶部含显著的嗜酸性颗粒。该细胞可产生肠肽酶和溶菌酶，也含锌，有激活肠肽酶的作用。禽无潘氏细胞（图3）。

图3 小肠的肠腺

与小肠基本相似，主要特点是：哺乳动物的大肠粘膜无环形皱襞和绒毛，而具纵皱襞。肠腺长而直，可伸到粘膜下层，杯状细胞特别多，无潘氏细胞：分泌碱性粘液，不含消化酶，但含溶菌酶。淋巴小结增多。肌层特别发达，猪与马的盲、结肠和兔的结肠纵行肌形成肌带，马的纵肌带中含较多的弹性纤维。禽类大肠的特点是粘膜具绒毛，肠腺较少，淋巴组织在盲肠起始附近特别发达，形成盲肠扁桃体。鸽的盲肠无绒毛，淋巴组织多于腺组织。直肠管壁较厚，绒毛短而宽，杯状细胞和内分泌细胞较多。

泄殖腔是两栖、爬行及禽类等动物肠管末端膨大而成的腔道，为消化、泌尿和生殖三系统的共同通道。禽类的泄殖腔以一环行和一半月形粘膜褶分为粪道、泄殖道和肛道三部。在幼禽肛道的背侧壁有腔上囊开口。泄殖腔粘膜也有绒毛，粘膜上皮在肛门背、腹唇的内侧突然转变为复层扁平上皮。肛道的粘膜内有肛腺，粘膜下层常含大量的淋巴组织；后部的肌层和括约肌中均含横纹肌纤维。肛道和肛门两唇的上皮内具有大量的赫伯斯特小体，对振动特别敏感。

肛门是消化管终端一短的肛门管。在肛直肠线处，直肠的柱状上皮突然转变为复层扁平上皮。在猪和食肉类，粘膜形成若干纵向的肛柱，肛柱间凹陷为肛窦。粘膜下层内含变异的汗腺（肛腺），其分泌物在食肉类为脂性、猪为粘性。皮区的上皮角质化。狗于肛皮线附近两侧有肛旁窦的小开口，窦壁粘膜内含肛旁窦腺，分泌暗灰色具难闻气味的脂肪样物质。另外，在与肛门皮肤连接处附近的粘膜内含变异的皮脂腺和汗腺——环肛腺。肌层的内环行平滑肌形成肛门内括约肌，外面为横纹肌构成的肛门外括约肌。肛门皮肤薄、无毛，含许多皮脂腺和汗腺。