动物机体内执行免疫功能的器官和组织，根据其发生和作用的不同，可分为中枢免疫器官和外周免疫器官。免疫器官和免疫细胞及免疫分子共同组成机体的免疫系统（immune system）。

又称一级免疫器官，发生在胚胎早期，起源于内外胚层联接处，为诱导淋巴干细胞成为免疫活性细胞（T细胞和B细胞）的场所以及向外周免疫器官输送的枢纽。其健全和正常与否，都将严重影响机体的免疫功能。

位于胸腔前纵隔中，有的延伸至颈部，其形态因动物而异，其发育亦随年龄增长而有明显变化，幼龄发育最快，青春期后逐渐退化萎缩，最后为脂肪和结缔组织所代替，但仍保持一定功能。

胸腺组织主要由胸腺细胞（不同成熟程度的淋巴细胞）和上皮网状细胞组成。皮质中上皮网状细胞较稀疏，形成网格，大量胸腺细胞充塞其中，髓质中主要为上皮性网状细胞，其间含有由扁平细胞呈同心圆排列形成的胸腺小体（哈索尔小体，Hasall's corpuscle）（图1）。胸腺能分泌一组低分子多肽，总称胸腺激素，包括十几种功能不同的因子，如胸腺素、胸腺生成素、胸腺体液因子、淋巴细胞刺激素等。这些因子诱导淋巴干细胞成为T细胞，通过毛细血管后静脉进入血流，输送至外周免疫器官，参与细胞免疫应答。新生动物切除胸腺可引起严重的细胞免疫缺陷，体液免疫亦受到一定程度的影响；成年动物切除胸腺对免疫功能影响较小。某些病毒感染可损害胸腺，引起类似的免疫缺陷病。

图1 胸腺小叶一角的模式

鸟类特有的免疫器官，为球形或圆柱状盲囊，位于泄殖腔后上方，又称腔上囊（图2）。最早由美籍华人张先光所发现。法氏囊囊壁内侧有十数条纵行皱褶，在皱褶的固有层中含有大量淋巴组织，其分泌的囊激素能诱导淋巴干细胞分化成B细胞，经血流输送到外周免疫器官，参与体液免疫应答。幼雏切去法氏囊或感染传染性法氏囊病可引起体液免疫缺陷。

图2 禽类的免疫器官

哺乳动物没有法氏囊。鉴于B细胞的前体已在骨髓中大量发现，多认为骨髓既是多能干细胞的产生部位，又具法氏囊类同器官的作用；也有认为肠道集合淋巴小结（即裴氏结，Peyer's patches）和扁桃体是法氏囊类似器官。

为哺乳动物的造血器官，也是各种免疫细胞的发源地，具有过滤和调节血细胞的发生与释放的功能，并能清除衰老和死亡的细胞；还被认为是法氏囊类同器官。骨髓在免疫形成中起重要作用，动物经X线照射破坏其淋巴组织后，输入骨髓可使该组织得以重建，并保护动物免于死亡。骨髓中含有大量的B细胞和浆细胞，是产生抗体的重要器官，因此它同时也是外周免疫器官。

又称二级免疫器官。发生在胚胎后期的中胚层，是免疫活性细胞定居、增殖和发生免疫应答的场所。

脾脏

具有过滤、贮血、造血和免疫等功能。其髓质分白髓和红髓两部分。白髓由围绕中央动脉的索状淋巴鞘和球状脾小体构成，前者主要含T细胞；后者中央为生发中心，含B细胞，其外周为T细胞。红髓位于白髓周围，含有大量巨噬细胞及其他免疫细胞。脾脏中B细胞含量占免疫活性细胞的50～65%，因而是产生抗体的重要器官。同时亦以其红髓所含吞噬性细胞捕捉血循中的抗原物质。

淋巴结

分布于全身淋巴循环的通道上，由皮质和髓质组成。皮质中有大量淋巴小结，由淋巴细胞组成，其中央部分为生发中心，为B细胞集中区；小结间为副皮质区，主要为T细胞。髓质可分为髓索和髓窦。前者为B细胞后留处，并有许多浆细胞、网状细胞和巨噬细胞，后者含有巨噬细胞和树状突细胞，为过滤淋巴液的场所。淋巴结中T细胞占免疫活性细胞的70～75%，是发生免疫应答的重要场所（图3）。

扁桃体

病原微生物主要的侵入门户，易于接受抗原刺激。表面被有复层扁平上皮，上皮向粘膜内凹入形成许多隐窝，隐窝周围分布有大量淋巴小结及弥散淋巴组织。含有多种浆细胞，可以产生各种抗体。

图3 淋巴结模式

肠道集合淋巴小结

肠道粘膜下存在的球形、致密的淋巴组织、无被膜，内有生发中心，含有B细胞及浆细胞等，易产生IgA。