由尖孢镰刀菌侵染棉株维管束引起植株萎蔫的真菌性病害。1891年，美国阿拉巴马州首次发现。

南美洲、北美洲、亚洲、非洲、欧洲的29个国家均有发生。中国在20世纪70年代调查，东北、西北、黄河流域和长江流域的20个省、市，几乎都有发生为害，以陕西、四川、江苏、云南、山西、山东、河南等省为害严重。

棉株的不同生育阶段，其症状因品种和自然环境的不同而异：苗期有青枯型、半边黄型、黄色网纹型、皱缩型、紫红型、黄化型；蕾期有皱缩型、半边黄型、枯斑型和顶枯型，严重的病株落叶成光杆型。病株维管束呈棕褐色，纵贯全株。棉株在3～4片真叶或蕾期为发病高峰，重病株枯死，造成缺株；一般病株表现株矮、节间缩短，或半边枯死，结铃稀疏，吐絮不畅，易脱落。一般减产10%～20%，严重时达30%～40%。

病原物是尖孢镰孢萎蔫专化型（Fusarium oxysporum f.sp.vesinfectum），属半知菌，瘤座孢目。小分生孢子单胞、卵圆形，无色；厚垣孢子圆形、顶生或间生，常数个相连。大型分生孢子足胞不明显，镰刀形，多数为3个隔膜，大小为16.2～47.1×2.6～5.1（微米）。1992年陈其煐报道，大型分生孢子可分为3个培养型。Ⅰ型：为对称镰刀形或纺锤型，顶细胞较长，逐渐变窄狭，足细胞明显或不明显，孢子3个隔膜；Ⅱ型：为不对称镰刀形，或新月形稍直，顶细胞长，孢子3～5个隔膜，最多达8个；Ⅲ型：孢子短宽，顶细胞钝圆或有喙，背部三分之一处变宽，足细胞明显或不明显，基部变窄，孢子3个隔膜。在不同培养基上菌落形状和色素均有差异（见图）。

根据病菌致病力的变异目前分为7个生理小种：阿姆斯倡（G.M.Armstrong and J.k.Arrnostrong，1960）研究证明埃及棉花枯萎病菌仅侵害海岛棉，印度棉花枯萎病菌只侵害亚洲棉，美国棉花枯萎病菌能侵害陆地棉、海岛棉，不侵染亚洲棉，其中一个菌系可以侵染大豆及烤烟，另有一个菌系则不能，据此区分为4个生理小种；亦别雷赫（Ibrahim.1966）测定苏丹的棉花枯萎病菌可以同时侵染陆地棉，海岛棉和亚洲棉，称5号小种；阿姆斯倡（G.M.Armstrong，1979）报道巴西的棉枯萎病菌只侵染陆地棉，称6号小种；陈其煐等（1986）研究中国枯萎病菌，在国际统一鉴别寄主上测定，其致病力最强，所有供测棉花寄主均可感病，称生理小种7号（见表）。

60年代前认为棉花枯萎病菌专化性很强，只能侵害棉花。近年研究，棉枯萎病菌的寄主范围较广，英国伊贝尔氏（L.Ebbels，1975）统计，能够直接从病株分离到棉花枯萎病菌的植物有棉花、大豆、烟草等40余种。1977年以后，中国测定出棉花枯萎病菌寄主植物有20余种。

不同抗性的棉花品种感染棉花枯萎病的程度明显不同，陆地棉、亚洲棉和海岛棉的抗性差异是由感病到抗病而不同，其中已列为主要抗原的是陆地棉品种川52-128。

棉枯萎镰刀菌大型分生孢子培养型

不同生理小种对寄主的侵染

棉花枯萎病在田间的消长，与品种抗感性、生育阶段以及土壤温、湿度关系密切。经测定土温在20～27℃发病最重，28～31℃有所降低，32℃以上停止发展。土壤含水量在60%～75%，发病率最高。棉株现蕾阶段是棉花枯萎病发病高峰，一般6月至7月份雨水多，分布匀，发病重。棉田线虫与发病关系密切，美国在选育品种抗性时，将线虫与棉枯萎病作为复合病害同时考虑。

棉花枯萎病菌在土壤中通过根系侵染棉花植株，为害维管束系统，导致棉株萎蔫。萎蔫发生的原因有两种解释：一种解释认为菌丝体穿过内皮层进入导管，并在导管里迅速繁殖，菌丝体堵塞导管，阻碍水分运转而引起植株萎蔫，与菌丝体堵塞的同时伴有树胶和凝胶体的聚积，也影响水分的运转；另一种解释认为由于病原菌产生的毒素引起植物细胞组织中毒，例如植株在感染反应中形成酚类物质毒害组织而导致萎蔫。镰刀菌毒素的存在既降低细胞保持水分的能力，又破坏原生质膜的渗透性。近年来，菌丝堵塞和毒素为害经组织切片和生化分析所证实，且趋向一致。

病株各个器官均带菌，在病害传播中，以带菌种子和土壤中的病残体为主要侵染源。带菌种子可远距离传播，土壤中的病残体能借水流或机具携带等作近距离传播。棉田一旦传入枯萎病菌则很难铲除，病菌在土壤中可存活8～10年。

贯彻“预防为主，综合防治”的原则，严格检疫，禁止病区种子调入，建立无病留种田和供种基地，保护无病区，确需引进调出棉种，需进行硫酸脱绒，402温汤浸种半小时，或用0.3%多菌灵胶悬剂冷浸14小时，消灭种子带菌，达到检疫标准；零星病株，可选用氯化苦乳剂、溴甲烷“棉隆”原粉等药剂消毒土壤，减少土壤中的病原菌数量；水旱轮作，实行三年水稻一年棉花的轮作制；选用高产优质抗病品种，减轻重病田的产量损失，中国从50年代到80年代几次更新棉花品种，先后推广的有川52-128、陕401、宁86-1、盐48、中棉12号等，至1990年中国抗病品种种植面积约占棉田总面积的44.1%。